Juodupė es una villa rural en el municipio de distrito de Rokiškis, en el condado de Panevėžys, Lituania. Juodupė se encuentra a 115 m de altitud. Su población es de 1.549 habitantes (2021). La ciudad grande más cercana es Utena, a 66 km al sur. Cerca de la frontera: Letonia, a 4,7 km. Entre los lugares de interés cercanos: Lutheran church in Asare (17,6 km), Lutheran church in Nereta (23 km) y Kurmišku pilskalns (13,3 km). Entre los parajes naturales: Krastiņu Karātavu Hill (15,0 km).
También escrito Juodupė.