Niniškės es una aldea en el municipio de distrito de Molėtai, en el condado de Utena, Lituania. Niniškės se encuentra a 182 m de altitud. La ciudad grande más cercana es Utena, a 20 km al noreste. Entre los lugares de interés cercanos: Molėtai Astronomical Observatory (5,6 km), Lithuanian Museum of Ethnocosmology (5,2 km) y Synagogue of Alanta (12,0 km).

También escrito Niniškės.